Arnaud Sénécaut
Scientifique interdisciplinaire
Titulaire d'une Licence Biologie Cellulaire et Moléculaire ainsi que d'un DUT Informatique, je poursuis mes études en Master de Physiopathologie intégrative axé sur les cellules normales, cancéreuses et thérapies, afin de spécialiser mes compétences dans la recherche fondamentale et interdisciplinaire en thérapies anticancéreuses.
Experience
Profilage protéomique spatial de CHC déficitaires en alpha-1 antitrypsine par spectrométrie de masse
Je développe une méthode d'analyse statistique supervisée appliquée à des données issues de spectrométrie de masse spatialisée (MALDI-ToF), afin d'identifier une signature protéomique différentielle des carcinomes hépatocellulaires associés à un déficit en alpha-1 antitrypsine. Mon travail inclut le traitement des images spectrales, la normalisation inter-échantillons, l'alignement des spectres, la sélection de pics pertinents, ainsi que l'analyse différentielle via R (Cardinal) et C++.
Développement d'une méthode d'analyse protéomique par crosslink et spectrométrie de masse
J'ai codéveloppé une méthode d'étude des profils conformationnels et des partenaires du complexe APC/C CDC20 par crosslink et spectrométrie de masse (technologie Orbitrap). Cette méthode innovante sera utilisée ultérieurement pour caractériser les changements structurels dynamiques de l'APC/C. Cette stratégie permet de "geler" rapidement l'interaction biochimique en cours dans son état actuel et permet d'identifier les interactions momentanées et faibles.
Développement d'une application mission critique d'aide au calcul de dosage médicamenteux en situation d'urgence.
J'ai concu et développé une application mission critique d'aide au calcul de dosage et à la préparation médicamenteuse dans le cadre du projet ADCEM, ayant pour objectif d'aider les soignants à gagner en rapidité de prise en charge.
Dévelopement d'interface bioinformatique
Durant ce stage volontaire, j'ai développé trois nœuds KNIME en Java et C++ pour simplifier l'utilisation du logiciel RAId du NCBI, avec optimisations des interfaces utilisateur et conception d'algorithmes performants en termes de temps de calcul et d'espace mémoire.
Formation
Je me spécialise dans l'étude des mécanismes biologiques fondamentaux à différents niveaux d'organisation, de la molécule à l'organisme, en explorant de manière approfondie les interactions complexes entre cellules normales et cancéreuses, ainsi que les approches thérapeutiques innovantes. Ce programme de formation de haut niveau, résolument interdisciplinaire, vise à former des experts capables de comprendre et de résoudre les enjeux émergents de la biologie contemporaine, en intégrant les connaissances des sciences fondamentales et leur application dans les domaines biomédicaux, écologiques et thérapeutiques.
J'ai acquis des compétences solides en biologie cellulaire, génétique et biotechnologie. J'ai maîtrisé diverses techniques de laboratoire telles que la culture cellulaire, la PCR, et l'électrophorèse. Mon expérience m'a permis de développer une approche scientifique rigoureuse, avec une capacité à analyser et interpréter des données. J'ai également renforcé mes aptitudes à travailler en équipe et à communiquer les résultats de manière claire et précise.
J'ai acquis des compétences en développement logiciel, en administration de systèmes et réseaux (Linux) ainsi qu'en gestion de bases de données relationnelles. J'ai également appris à travailler en méthodologie agile (Scrum) à travers des projets collaboratifs.